Через два роки після того, як Таємна корпорація розпалася через виниклі протиріччя, Скубі-Ду і його кмітливі приятелі, що розкрили не один злочин, Фреда (Фредді Принц-Молодший), Дафну (Сара Мішель Геллар), Шеггі (Метью Ліллард) і Велму (Лінда Карделліні), по одному викликають на Лиховісний острів, щоб вони почали розслідування серії паранормальних явищ, що відбуваються у Спрінг-Брейк. Побоюючись, що його неймовірно популярний курорт насправді може бути населений примарами, власник Лиховісного острова Еміль Мондаваріус (Роуан Аткінсон) намагається возз'єднати легендарних детективів, щоб ті розгадали загадку, поки надприродна таємниця не розполохала всіх відпочиваючих студентів. Скубі-Ду і його команді доведеться перебороти особисті розбіжності і по-новому глянути на уявних вампірів і нереальних примар. І все це, щоб розплутати справа, урятувати самих себе, а можливо... й увесь світ.